玛瑙的颜色丰富，有红、绿、黄、白、蓝、黑等多种颜色，在光线下可以呈现蜡状光泽，内部结构比较致密。而翡翠的颜色总体偏绿色，在光线下可以呈现出锐利的玻璃光泽，用放大镜观察可以看到内部的晶体颗粒，结构相对松散。
颜色不同是玛瑙和翡翠玉石的主要区别之一，玛瑙的颜色比较丰富，有红、绿、黄、白、黑、蓝等多种颜色，而翡翠的颜色虽然也比较丰富，但是总体偏绿色系。
此外玛瑙和翡翠的光泽也存在一定区别，将玛瑙和翡翠分别放在光线下观察时，可以发现玛瑙呈现出来的是蜡状光泽，而翡翠呈现出来的是玻璃光泽。
玛瑙和翡翠的结构同样存在区别，玛瑙的的结构比较致密，用放大镜看不到结晶体的颗粒。而翡翠中有矿物颗粒，结构相对较松散，用放大镜可以看到晶体颗粒。
